להלן רשימת המחלקות בקמפוס אלקנה:

לשכת נשיא המכללה

לשכת הרקטור

משאבי אנוש

אגף כספים

רישום שיווק

מינהל סטודנטים

גזברות ושכר לימוד

דיקנות סטודנטיות ותחום תורני

מדור בחינות

רווחת סטודנטיות

מינהל אקדמי

היחידה לכניסה להוראה

מח' השתלמויות, לימודי חוץ והסבת אקדמאים

יח' מחשבים

היחידה להוראה דיגיטלית

ספרייה

מרכז השראה

תפעול / אחזקה