להלן רשימת המחלקות במכללה:

לשכת נשיא המכללה

לשכת הרקטור

משאבי אנוש

אגף כספים

קמפוס אלקנה

רישום שיווק

מינהל סטודנטים

גזברות ושכר לימוד

דיקנות סטודנטיות ותחום תורני

מדור בחינות

רווחת סטודנטיות

יח' מערכות מידע - IT

תפעול / אחזקה

מינהל אקדמי

היחידה להוראה דיגיטלית

היחידה לכניסה להוראה

ספרייה

מרכז השראה

מח' השתלמויות, לימודי חוץ והסבת אקדמאים

קמפוס רחובות

לשכת ראש הקמפוס

ישיבת ההסדר "אורות יעקב"

רישום

דיקנות סטודנטים

מינהל תלמידים

מזכירות בני ישיבות

שכר לימוד

כספים ומשאבי אנוש

ספרייה

תפעול

יחידת מחשבים

יחידה ללימודים דיגיטליים

מנהל אקדמי - קמפוס רחובות